-加權基因共表達網絡分析(WGCNA)
Demo結果
Demo結果解讀
基于加權共表達的計算,利用平均層次聚類的模塊的劃分,模塊與性狀之間的相關性,挑選出顯著性的性狀,構建相應網絡圖,從而找到與性狀相關的核心基因。
加權基因共表達網絡分析(WGCNA)
尋找協同表達的基因模塊(module),并探索基因網絡與關注的表型之間的關聯關系,以及網絡中的核心基因。
分析要求
樣本數量在3組以上,并且每組的樣本重復為3個或3個以上。
提供結果
- 圖片文件:cluster tree,module relation等;
- 文本文件:每個module的所屬基因,以及基因之間的相關性;module之間的相關性。