-lncRNA和mRNA共表達分析

Demo結果

Demo結果解讀

網絡圖為篩選出的核心基因之間的關系，通過圖論的方法計算出關鍵lncRNA與mRNA，并通過關鍵lncRNA的共表達mRNA預測出其功能。

lncRNA和mRNA共表達分析介紹

共表達網絡圖（Coexpression Network）是根據基因表達信號值的動態變化，計算基因間的共表達關系，得到基因間的表達調控關系及調控方向，從而構建基因的表達調控網絡。通過研究lncRNA與mRNA的共表達關系，研究者可通過分析lncRNA調控能力，獲得樣本隨實驗變化的核心調控lncRNA。

分析要求

每組數據3個或3個以上生物學重復，每個樣本均含有lncRNA與mRNA數據，差異基因或者關注的部分基因。

提供結果

1. 圖片文件（Network圖），包括png,PDF格式；
2. Cytocape文件：可以cytoscape打開進行細節調整；
3. 文本文件：基因之間共表達相關性以及顯著性，lncRNA,mRNA核心共表達的排序。